理论上来说，洁净棚也是属于无尘车间的一种，其结构和建造的原理都是类似的。但除了规格之外，这两者还有一点存在着一定的差别，那就是压差的控制。
    相对于洁净棚来说，无尘车间的压差较好控制。主要原因在于无尘车间同时存在这送风量、回风量和排风量三种空气循环通道。只需要送风量大于回风量和排风量，则室内就可以呈现正压差。而在这种情况下，由于结构不紧密而产生的风量泄漏就可以得到控制。
    但是洁净棚由于规格原因是不存在回风的，也就是说需要送风量和排风量之间来做加减。但由于建造等因素，洁净棚是没有办法做到如无尘车间那样的严密性的，再加上空间的温湿度差，洁净棚的压差就变得较难控制了。